动静健康丨贵州首个病原微生物宏基因组检测平台落户贵黔

大健康事业部转载自贵黔国际总医院订阅号 | 2023-04-13 17:41

病原微生物种类众多,稍有不慎便在人体“生根发芽”,如不及时治疗清除致病菌,便会侵害人体,造成严重感染疾病。对于临床危重病人而言,复杂病菌感染更是家常便饭,也是最让临床医生头疼的事情。

随着临床对复杂疑难感染疾病疑似致病菌高效、灵敏、快速检出需求的增加,在传统病原微生物检测方法基础上,宏基因组检测(metagenomic next generation sequencing,mNGS)应运而生,可精确检出复杂感染疾病疑似致病菌,并进行对应诊疗清除。

2022年7月,贵黔医院精准医学中心完成了第一例病原微生物宏基因组样本检测(mNGS)并发布了检验报告,至今已完成数千例检测,高效解决了临床对复杂感染疾病精准诊疗的需求。

这是贵州首个病原微生物宏基因组检测平台成功落地并投入使用,正式开启了贵州精准医疗新篇章。

贵黔精准医学中心病原微生物宏基因组平台采用先进设备——华大MGISEQ-200测序仪,专利文库构建方法检测,可以接收贵州省及邻近省份各大医疗机构的样本,满足临床医生对DNA、RNA类病原体检测需求,同时提供完善的报告咨询解读服务。

目前,mNGS在临床应用十分广泛,采用高通量测序技术对临床样本中所有核酸进行测序,并通过生物信息学分析判断样本中是否存在病原微生物及其携带的耐药基因和毒力基因。

相较于传统病原微生物学检测方法,mNGS的优势非常明显,检测时间更短,范围更广,效率更高,可弥补传统病原微生物学检测方法漏检病原体问题,并且能够联合传统病原微生物检测方法检测,提高病原体诊断敏感性特异性。mNGS适用于临床九大感染类型(见图1)。

图1:mNGS适用于临床九大感染类型

据了解,贵州省的病原微生物宏基因组样本都需要送到外省进行检测,报告最快也要24—48小时。而现在,有了贵黔医院精准医学中心搭建的检测平台,可控制在24小时内出具宏基因组检测报告。这对感染性疾病,尤其是重症患者、急性或疑难感染者病原体的快速诊断具有重大意义。

助力临床精准诊疗,保障患者生命健康。贵黔医院精准医学中心病原微生物宏基因组检测平台(mNGS)竭诚为全省乃至全国医疗机构服务,高效精准为临床医生综合诊断感染来源提供了重要依据,为众多危重患者确定治疗方案争取宝贵时间,为贵州精准医疗事业贡献力量。

病原微生物宏基因组检测指引——

精准医学中心简介

贵黔医院精准医学中心是贵州首个精准医学中心,由贵黔医院与金域医学合作共建,集医、教、研为一体的现代化区域临床医学检测中心,旨在为肿瘤、遗传病、罕见病、不明原因感染性疾病、用药安全等提供精准医疗服务。

中心使用面积约1100㎡,搭建有高通量基因测序(包括遗传病、肿瘤基因检测,病原微生物宏基因组检测,无创产前DNA检测);质谱检测;流式细胞学检测平台;荧光定量PCR和全自动核酸检测(包括新型冠状病毒核酸检测、乙肝病毒检测)等先进高新技术平台。

中心已开展项目涵盖病原微生物检测、遗传病/罕见病/肿瘤的基因检测、用药安全、癌症早筛、基因体检、遗传代谢病筛查等。还提供遗传咨询和肿瘤基因诊疗咨询服务,助力于出生缺陷防控和癌症的早筛和精准诊疗,助力实现健康中国战略。